Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms