Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms