Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk1dQ9DC28 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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