Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms