Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syvn1Q9DBY1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms