Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms