Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms