Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms