Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms