Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sh2d4aQ9D7V1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sh2d4aQ9D7V1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sh2d4aQ9D7V1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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