Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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