Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms