Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Rab11fip1Q9D620 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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