Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D5Q8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms