Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms