Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms