Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms