Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms