Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrnp35Q9D384 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms