Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D2Q3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms