Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms