Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpsap1Q9D0M1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.3 ms