Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms