Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ2

Tpd52l2, Tumor protein D54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l2Q9CYZ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52l2Q9CYZ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpd52l2Q9CYZ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms