Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChtopQ9CY57 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms