Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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