Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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