Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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