Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CWU4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CWU4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CWU4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CWU4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CWU4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CWU4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CWU4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CWU4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CWU4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CWU4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CWU4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CWU4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CWU4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CWU4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CWU4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CWU4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms