Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6kQ9CWP4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms