Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms