Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms