Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms