Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Q9CQC3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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