Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms