Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm22Q9CPQ3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms