Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brms1Q99N20 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms