Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac9Q99N13 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms