Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gins4Q99LZ3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms