Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms