Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TriobpQ99KW3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms