Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp11Q99K46 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms