Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms