Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms