Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms