Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms