Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf4Q8VE97 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf4Q8VE97 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms