Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smg8Q8VE18 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smg8Q8VE18 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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