Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol9aQ8VDU3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol9aQ8VDU3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms