Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms